LsrA/cI - Revision history

XiZhu at 15:27, 28 July 2008

2008-07-28T15:27:37Z

XiZhu at 15:26, 28 July 2008

2008-07-28T15:26:51Z

XiZhu at 18:13, 15 July 2008

2008-07-15T18:13:22Z

XiZhu at 18:09, 15 July 2008

2008-07-15T18:09:05Z

XiZhu at 18:05, 15 July 2008

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XiZhu at 18:01, 15 July 2008

2008-07-15T18:01:04Z

XiZhu at 17:57, 15 July 2008

2008-07-15T17:57:54Z

XiZhu at 20:10, 11 July 2008

2008-07-11T20:10:47Z

AlAllen at 15:44, 10 July 2008

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XiZhu at 22:11, 8 July 2008

2008-07-08T22:11:15Z

@@ Line 32: / Line 32: @@
 | 2|| B0034 ||RBS ||R/X; S/P||S/P || 12+2079||K091002||lsrK  ||R/X;S/P  ||X/P  ||1593 ||K091158 ||1611
 |-
-| 3||I13453||pBAD ||R/X;S/P ||S/P || 120+2079||TBD||RBS+lsrK ||R/X; S/P  ||X/P  || ||K091159 || 1866
+| 3||I13453||pBAD ||R/X;S/P ||S/P || 120+2079||TBD||RBS+lsrK ||R/X; S/P  ||X/P  ||1611 ||K091159 || 1866
 |-
 | 4||B0015||TT||R/X; S/P ||R/X ||129+2079 ||K091138 ||RBS+lsrR  ||R/X; S/P  ||R/S  || 972||K091139 ||1109
 |-
-| 5||K091139||RBS+lsrR+TT||R/X; S/P ||R/X ||1109+2079 ||TBD ||pBAD+RBA+lsrK  ||R/X; S/P  ||R/S  || ||TBD ||
+| 5||K091139||RBS+lsrR+TT||R/X; S/P ||R/X ||1109+2079 ||TBD ||pBAD+RBA+lsrK  ||R/X; S/P  ||R/S  ||1866 ||TBD ||
 |-
 | 6|| K091106 ||pLsrA/cI ||R/X; S/P ||S/P || 141+2079||C0261||RBS+luxI  ||R/X; S/P  ||X/P  ||661 ||K091140||810

@@ Line 30: / Line 30: @@
 | 1|| B0034 ||RBS ||R/X; S/P||S/P || 12+2079||K091001||lsrR  ||R/X;S/P  ||X/P  ||954 ||K091138 ||972
 |-
-| 2|| B0034 ||RBS ||R/X; S/P||S/P || 12+2079||K091002||lsrK  ||R/X;S/P  ||X/P  ||1593 ||TBD ||
+| 2|| B0034 ||RBS ||R/X; S/P||S/P || 12+2079||K091002||lsrK  ||R/X;S/P  ||X/P  ||1593 ||K091158 ||1611
 |-
-| 3||I13453||pBAD ||R/X;S/P ||S/P || 120+2079||TBD||RBS+lsrK ||R/X; S/P  ||X/P  || ||TBD ||
+| 3||I13453||pBAD ||R/X;S/P ||S/P || 120+2079||TBD||RBS+lsrK ||R/X; S/P  ||X/P  || ||K091159 || 1866
 |-
 | 4||B0015||TT||R/X; S/P ||R/X ||129+2079 ||K091138 ||RBS+lsrR  ||R/X; S/P  ||R/S  || 972||K091139 ||1109

@@ Line 34: / Line 34: @@
 | 3||I13453||pBAD ||R/X;S/P ||S/P || 120+2079||TBD||RBS+lsrK ||R/X; S/P  ||X/P  || ||TBD ||
 |-
-| 4||B0015||TT||R/X; S/P ||R/X ||129+2079 ||TBD ||RBS+lsrR  ||R/X; S/P  ||R/S  || ||K091139 ||1109
+| 4||B0015||TT||R/X; S/P ||R/X ||129+2079 ||K091138 ||RBS+lsrR  ||R/X; S/P  ||R/S  || 972||K091139 ||1109
 |-
 | 5||K091139||RBS+lsrR+TT||R/X; S/P ||R/X ||1109+2079 ||TBD ||pBAD+RBA+lsrK  ||R/X; S/P  ||R/S  || ||TBD ||
@@ Line 42: / Line 42: @@
 | 7||B0015 ||TT ||R/X; S/P ||R/X ||129+2079 ||I13025 ||RBS+Mnt  ||R/X;S/P  ||R/S  ||331 ||K091141 ||468
 |-
-| 8||K091141||RBS+Mnt+TT ||R/X; S/P ||R/X || 468||K091140 ||pLsrA/cI+RBS+luxI  ||R/X; S/P  ||R/S  ||810 || TBD||
+| 8||K091141||RBS+Mnt+TT ||R/X; S/P ||R/X || 468+2079||K091140 ||pLsrA/cI+RBS+luxI  ||R/X; S/P  ||R/S  ||810 || K091142||1286
 |-
 |}

@@ Line 36: / Line 36: @@
 | 4||B0015||TT||R/X; S/P ||R/X ||129+2079 ||TBD ||RBS+lsrR  ||R/X; S/P  ||R/S  || ||K091139 ||1109
 |-
-| 5||TBD||RBS+lsrR+TT||R/X; S/P ||R/X || ||TBD ||pBAD+RBA+lsrK  ||R/X; S/P  ||R/S  || ||TBD ||
+| 5||K091139||RBS+lsrR+TT||R/X; S/P ||R/X ||1109+2079 ||TBD ||pBAD+RBA+lsrK  ||R/X; S/P  ||R/S  || ||TBD ||
 |-
 | 6|| K091106 ||pLsrA/cI ||R/X; S/P ||S/P || 141+2079||C0261||RBS+luxI  ||R/X; S/P  ||X/P  ||661 ||K091140||810
 |-
-| 7||B0015 ||TT ||R/X; S/P ||R/X ||129+2079 ||I13025 ||RBS+Mnt  ||R/X;S/P  ||R/S  ||331 ||TBD ||
+| 7||B0015 ||TT ||R/X; S/P ||R/X ||129+2079 ||I13025 ||RBS+Mnt  ||R/X;S/P  ||R/S  ||331 ||K091141 ||468
 |-
-| 8||TBD ||RBS+Mnt+TT ||R/X; S/P ||R/X || ||TBD ||pLsrA/cI+RBS+luxI  ||R/X; S/P  ||R/S  || || TBD||
+| 8||K091141||RBS+Mnt+TT ||R/X; S/P ||R/X || 468||K091140 ||pLsrA/cI+RBS+luxI  ||R/X; S/P  ||R/S  ||810 || TBD||
 |-
 |}

@@ Line 38: / Line 38: @@
 | 5||TBD||RBS+lsrR+TT||R/X; S/P ||R/X || ||TBD ||pBAD+RBA+lsrK  ||R/X; S/P  ||R/S  || ||TBD ||
 |-
-| 6|| K091106 ||pLsrA/cI ||R/X; S/P ||S/P || 141+2079||C0261||RBS+luxI  ||R/X; S/P  ||X/P  ||661 ||TBD||
+| 6|| K091106 ||pLsrA/cI ||R/X; S/P ||S/P || 141+2079||C0261||RBS+luxI  ||R/X; S/P  ||X/P  ||661 ||K091140||810
 |-
 | 7||B0015 ||TT ||R/X; S/P ||R/X ||129+2079 ||I13025 ||RBS+Mnt  ||R/X;S/P  ||R/S  ||331 ||TBD ||

@@ Line 28: / Line 28: @@
 |'''Step'''|| '''BBa_''' || '''Description''' ||''' Pre-/suffix''' ||''' Enzymes '''||'''Size '''||'''BBa_'''||'''Description'''||'''Pre-/suffix'''||'''Enzymes'''||'''Size'''||'''BBa_'''||'''Size'''
 |-
-| 1|| B0034 ||RBS ||R/X; S/P||S/P || 12+2079||K091001||lsrR  ||R/X;S/P  ||X/P  ||954 ||TBD ||
+| 1|| B0034 ||RBS ||R/X; S/P||S/P || 12+2079||K091001||lsrR  ||R/X;S/P  ||X/P  ||954 ||K091138 ||972
 |-
 | 2|| B0034 ||RBS ||R/X; S/P||S/P || 12+2079||K091002||lsrK  ||R/X;S/P  ||X/P  ||1593 ||TBD ||

@@ Line 62: / Line 62: @@
 |-
 |[http://partsregistry.org/Part:BBa_C0261 C0261] ||RBS+luxI ||registry 07  ||Plt.1-24A ||pSB1A2 ||
 |-
 |[http://partsregistry.org/Part:BBa_I13025 I13025] ||RBS+Mnt ||registry 07  ||Plt.1-23J ||pSB1A2 ||

@@ Line 1: / Line 1: @@
 '''Goal''':
-'''pBAD+RBS+lsrK+RBS+lsrR+RBS+cI+TT+pLsrA/cI+RBS+LuxI+RBS+Mnt+TT'''
+'''pBAD+RBS+lsrK+RBS+lsrR+TT'''
-'''I13453'''+'''B0034'''+'''K091002'''+'''B0034'''+'''K091001'''+'''P0455'''(B0034+C0051+B0015)+'''K091106'''+'''C0261'''(B0034+C0061)+'''I13025'''(B0034+C0072)+'''B0015'''
+'''pLsrA/cI+RBS+LuxI+RBS+Mnt+TT'''
@@ Line 24: / Line 28: @@
 |'''Step'''|| '''BBa_''' || '''Description''' ||''' Pre-/suffix''' ||''' Enzymes '''||'''Size '''||'''BBa_'''||'''Description'''||'''Pre-/suffix'''||'''Enzymes'''||'''Size'''||'''BBa_'''||'''Size'''
 |-
-| 1|| B0034 ||RBS ||R/X; S/P||S/P || 12||K091001||lsrR  ||R/X;S/P  ||X/P  ||120 ||TBD ||
+| 1|| B0034 ||RBS ||R/X; S/P||S/P || 12+2079||K091001||lsrR  ||R/X;S/P  ||X/P  ||954 ||TBD ||
 |-
-| 2|| B0034 ||RBS ||R/X; S/P||S/P || 12||K091002||lsrK  ||R/X;S/P  ||X/P  ||516 ||TBD ||
+| 2|| B0034 ||RBS ||R/X; S/P||S/P || 12+2079||K091002||lsrK  ||R/X;S/P  ||X/P  ||1593 ||TBD ||
 |-
-| 3||I13453||pBAD ||R/X;S/P ||S/P || 120||TBD||RBS+lsrK ||R/X; S/P  ||X/P  || ||TBD ||
+| 3||I13453||pBAD ||R/X;S/P ||S/P || 120+2079||TBD||RBS+lsrK ||R/X; S/P  ||X/P  || ||TBD ||
 |-
-| 4||TBD||pBAD+RBS+lsrK||R/X; S/P ||S/P || ||TBD ||RBS+lsrR  ||R/X; S/P  ||X/P  || ||TBD ||
+| 4||B0015||TT||R/X; S/P ||R/X ||129+2079 ||TBD ||RBS+lsrR  ||R/X; S/P  ||R/S  || ||TBD ||
 |-
-| 5||P0455 ||RBS+cI+TT ||R/X; S/P ||R/X ||896 ||TBD ||pBAD+RBS+lsrK+RBS+lsrR  ||R/X; S/P  ||R/S  || ||TBD ||
+| 5||TBD||RBS+lsrR+TT||R/X; S/P ||R/X || ||TBD ||pBAD+RBA+lsrK  ||R/X; S/P  ||R/S  || ||TBD ||
 |-
-| 6|| K091106 ||pLsrA/cI ||R/X; S/P ||S/P || 141||C0261||RBS+luxI  ||R/X; S/P  ||X/P  ||661 ||TBD||
+| 6|| K091106 ||pLsrA/cI ||R/X; S/P ||S/P || 141+2079||C0261||RBS+luxI  ||R/X; S/P  ||X/P  ||661 ||TBD||
 |-
-| 7||B0015 ||TT ||R/X; S/P ||R/X ||129 ||I13025 ||RBS+Mnt  ||R/X;S/P  ||R/S  ||331 ||TBD ||
+| 7||B0015 ||TT ||R/X; S/P ||R/X ||129+2079 ||I13025 ||RBS+Mnt  ||R/X;S/P  ||R/S  ||331 ||TBD ||
 |-
 | 8||TBD ||RBS+Mnt+TT ||R/X; S/P ||R/X || ||TBD ||pLsrA/cI+RBS+luxI  ||R/X; S/P  ||R/S  || || TBD||
 |-
 |}

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	'''pBAD+RBS+lsrK+RBS+lsrR+RBS+cI+TT+pLsrA/cI+RBS+LuxI+RBS+Mnt+TT'''		'''pBAD+RBS+lsrK+RBS+lsrR+RBS+cI+TT+pLsrA/cI+RBS+LuxI+RBS+Mnt+TT'''

−	'''I13453'''+'''B0034'''+'''K091002'''B0034'''+'''K091001'''+'''P0455'''(B0034+C0051+B0015)+'''K091106'''+'''C0261'''(B0034+C0061)+'''I13025'''(B0034+C0072)+'''B0015'''	+	'''I13453'''+'''B0034'''+'''K091002'''+'''B0034'''+'''K091001'''+'''P0455'''(B0034+C0051+B0015)+'''K091106'''+'''C0261'''(B0034+C0061)+'''I13025'''(B0034+C0072)+'''B0015'''