CRISPR info

Found on CRISPRFInder:

Two confirmed CRISPRs:

CRISPR id : tmp_1_Crispr_12 START crispr position : 2723382 ---------- END crispr position : 2725579 ---------- Crispr length : 2197 DR consensus : GTTTCAGACGGACCCTTGTGGGATTGAAGC DR length : 30 Number of spacers : 33

CRISPR id : tmp_2_Crispr_1 START crispr position : 31920 ---------- END crispr position : 34849 ---------- Crispr length : 2929 DR consensus : GCTTCAATCCCACAAGGGTCCGTCTGAAAC DR length : 30 Number of spacers : 44

11 Questionable CRISPRs:

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_1 START crispr position : 451036 ---------- END crispr position : 451146 ---------- Crispr length : 110 DR consensus : CCTCGACCGTGTCGGCCGCGCCGCC DR length : 25 Number of spacers : 1

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_2 START crispr position : 451266 ---------- END crispr position : 451422 ---------- Crispr length : 156 DR consensus : CCTCGACCGTGTCGGCCGCGCCGCC DR length : 25 Number of spacers : 2

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_3 START crispr position : 723910 ---------- END crispr position : 724040 ---------- Crispr length : 130 DR consensus : CCGCCCGAACACGCCGGTCCCGACCACGAGAACGAGAC DR length : 38 Number of spacers : 1

RISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_4 START crispr position : 775514 ---------- END crispr position : 775595 ---------- Crispr length : 81 DR consensus : TGATTCGCCCAGCGAGCGCGTTCGTG DR length : 26 Number of spacers : 1

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_5 START crispr position : 1587713 ---------- END crispr position : 1587871 ---------- Crispr length : 158 DR consensus : TCGAAGGGGCTGTCGCTGTCGGTG DR length : 24 Number of spacers : 2

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_6 START crispr position : 1635784 ---------- END crispr position : 1635940 ---------- Crispr length : 156 DR consensus : CCTCGACCGTGTCGGCCGCGCCGCC DR length : 25 Number of spacers : 2

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_7 START crispr position : 1733154 ---------- END crispr position : 1733268 ---------- Crispr length : 114 DR consensus : GTTCGCCGGACCGTGTGGGTGTCG DR length : 24 Number of spacers : 2

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_8 START crispr position : 2087618 ---------- END crispr position : 2087725 ---------- Crispr length : 107 DR consensus : AGCGCCGGGCGACGACGGGCCAGC DR length : 24 Number of spacers : 1

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_9 START crispr position : 2127953 ---------- END crispr position : 2128039 ---------- Crispr length : 86 DR consensus : CGCTCGCTTCGAGGGCCGACACTCGCT DR length : 27 Number of spacers : 1

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_10 START crispr position : 2206888 ---------- END crispr position : 2206968 ---------- Crispr length : 80 DR consensus : CAGTCCAGTGAGGCGTCTCGTCGTCG DR length : 26 Number of spacers : 1

CRISPR id : tmp_1_PossibleCrispr_11 START crispr position : 2293949 ---------- END crispr position : 2294199 ---------- Crispr length : 250 DR consensus : CGTTCGCAGCAAAACGGGCCGGAAGGGATTTGAACC DR length : 36 Number of spacers : 2